Зангезур вошел в состав Армянской ССР, а вот решение относительно Арцаха было очень скоро пересмотрено. На заседании Пленума Кавказского Бюро ЦК РКП(б) от 5 июля 1921 года было решено передать Арцах (Нагорный Карабах) Азербайджанской ССР, «учитывая достаточно тесные экономические связи Верхнего и Нижнего Карабаха с Азербайджаном» с предоставлением областной автономии.
В Нахичевани в начале 1921 года путем опроса населения провели референдум, по результатам которого Нахичевань вошла в состав Азербайджанской ССР на правах автономной республики. Это стало возможным, поскольку к тому времени доля армянского населения Нахичевани сократилась с 45 % до 10 % в результате его истребления и вытеснения.