Новый король столкнулся с чередой восстаний и кровавых бунтов в Литве, а также с дальнейшими волнениями татар и казаков на юге Польше. Тем временем соседние Россия и Швеция, видя внутренние беспорядки в Речи Посполитой, сочли момент подходящим для возобновления военных действий. На севере шведы во главе с королем Карлом Х снова напали на Данциг, а затем заняли весь северо-запад страны. Россия вернула Смоленские и Северские земли и присоединила Левобережную Украину. В 1655 г., в разгар так называемого «Шведского потопа», королевская чета была вынуждена бежать из Кракова и искать убежища в Силезии.